Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
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