Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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