Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF2Q12933 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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