Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN1Q12860 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms