Protein–RNA interactions for Protein: Q12471

PFK27, 6-phosphofructo-2-kinase 2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFK27Q12471 YOL014WYOL014W 375 nt0.69□□□□□ -2.3
PFK27Q12471 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.69□□□□□ -2.3
PFK27Q12471 ASE1YOR058C 2658 nt0.69□□□□□ -2.3
PFK27Q12471 PMP1YCR024C-A 123 nt0.68□□□□□ -2.3
PFK27Q12471 TAR1YLR154W-C 375 nt0.68□□□□□ -2.3
PFK27Q12471 CMC4YMR194C-B 222 nt0.68□□□□□ -2.3
PFK27Q12471 NOP9YJL010C 2001 nt0.67□□□□□ -2.3
PFK27Q12471 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.67□□□□□ -2.3
PFK27Q12471 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.67□□□□□ -2.3
PFK27Q12471 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.67□□□□□ -2.3
PFK27Q12471 YPL044CYPL044C 549 nt0.67□□□□□ -2.3
PFK27Q12471 HMRA2YCR096C 360 nt0.66□□□□□ -2.3
PFK27Q12471 YDR102CYDR102C 333 nt0.66□□□□□ -2.3
PFK27Q12471 YPL225WYPL225W 441 nt0.66□□□□□ -2.3
PFK27Q12471 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.65□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 YNL211CYNL211C 261 nt0.65□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 SGF11YPL047W 300 nt0.65□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 YPR197CYPR197C 564 nt0.65□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.64□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 MYO1YHR023W 5787 nt0.63□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 YSP1YHR155W 3687 nt0.63□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.63□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.63□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.63□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.63□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.63□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.63□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 IQG1YPL242C 4488 nt0.63□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 COG8YML071C 1824 nt0.63□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 PAA1YDR071C 576 nt0.62□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 HMRA1YCR097W 381 nt0.61□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 GIM4YEL003W 336 nt0.61□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 NPR2YEL062W 1848 nt0.6□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 BEM3YPL115C 3387 nt0.59□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 CHS6YJL099W 2241 nt0.59□□□□□ -2.31
PFK27Q12471 snR60snR60 104 nt0.58□□□□□ -2.32
PFK27Q12471 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.58□□□□□ -2.32
PFK27Q12471 YMR321CYMR321C 318 nt0.58□□□□□ -2.32
PFK27Q12471 snR36snR36 182 nt0.58□□□□□ -2.32
PFK27Q12471 snR56snR56 88 nt0.57□□□□□ -2.32
PFK27Q12471 HTL1YCR020W-B 237 nt0.57□□□□□ -2.32
PFK27Q12471 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.57□□□□□ -2.32
PFK27Q12471 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt0.57□□□□□ -2.32
PFK27Q12471 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.57□□□□□ -2.32
PFK27Q12471 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.56□□□□□ -2.32
PFK27Q12471 RPL26BYGR034W 384 nt0.56□□□□□ -2.32
PFK27Q12471 RPS27BYHR021C 249 nt0.56□□□□□ -2.32
PFK27Q12471 YIL032CYIL032C 357 nt0.56□□□□□ -2.32
PFK27Q12471 VIK1YPL253C 1944 nt0.56□□□□□ -2.32
PFK27Q12471 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.55□□□□□ -2.32
PFK27Q12471 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt0.55□□□□□ -2.32
PFK27Q12471 YOR218CYOR218C 420 nt0.55□□□□□ -2.32
PFK27Q12471 BIR1YJR089W 2865 nt0.55□□□□□ -2.32
PFK27Q12471 YFL032WYFL032W 321 nt0.54□□□□□ -2.32
PFK27Q12471 YFL063WYFL063W 456 nt0.54□□□□□ -2.32
PFK27Q12471 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.54□□□□□ -2.32
PFK27Q12471 YML002WYML002W 2214 nt0.54□□□□□ -2.32
PFK27Q12471 ATP6Q0085 780 nt0.53□□□□□ -2.32
PFK27Q12471 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.52□□□□□ -2.33
PFK27Q12471 FYV10YIL097W 1551 nt0.52□□□□□ -2.33
PFK27Q12471 UTP10YJL109C 5310 nt0.52□□□□□ -2.33
PFK27Q12471 YDR413CYDR413C 576 nt0.51□□□□□ -2.33
PFK27Q12471 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.51□□□□□ -2.33
PFK27Q12471 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.51□□□□□ -2.33
PFK27Q12471 YOR015WYOR015W 360 nt0.51□□□□□ -2.33
PFK27Q12471 PRP5YBR237W 2550 nt0.51□□□□□ -2.33
PFK27Q12471 AI1Q0050 2505 nt0.5□□□□□ -2.33
PFK27Q12471 TRS65YGR166W 1683 nt0.5□□□□□ -2.33
PFK27Q12471 SEC8YPR055W 3198 nt0.5□□□□□ -2.33
PFK27Q12471 YER097WYER097W 330 nt0.5□□□□□ -2.33
PFK27Q12471 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.5□□□□□ -2.33
PFK27Q12471 ULP2YIL031W 3105 nt0.49□□□□□ -2.33
PFK27Q12471 HAL9YOL089C 3093 nt0.49□□□□□ -2.33
PFK27Q12471 YGL149WYGL149W 306 nt0.49□□□□□ -2.33
PFK27Q12471 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.49□□□□□ -2.33
PFK27Q12471 YKL118WYKL118W 312 nt0.49□□□□□ -2.33
PFK27Q12471 CSE2YNR010W 450 nt0.49□□□□□ -2.33
PFK27Q12471 snR190snR190 190 nt0.49□□□□□ -2.33
PFK27Q12471 MLP2YIL149C 5040 nt0.48□□□□□ -2.33
PFK27Q12471 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.48□□□□□ -2.33
PFK27Q12471 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.47□□□□□ -2.33
PFK27Q12471 COX5BYIL111W 456 nt0.46□□□□□ -2.34
PFK27Q12471 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.46□□□□□ -2.34
PFK27Q12471 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.46□□□□□ -2.34
PFK27Q12471 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.46□□□□□ -2.34
PFK27Q12471 MLP1YKR095W 5628 nt0.45□□□□□ -2.34
PFK27Q12471 OST4YDL232W 111 nt0.45□□□□□ -2.34
PFK27Q12471 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.45□□□□□ -2.34
PFK27Q12471 YOR345CYOR345C 351 nt0.45□□□□□ -2.34
PFK27Q12471 COY1YKL179C 2040 nt0.45□□□□□ -2.34
PFK27Q12471 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.44□□□□□ -2.34
PFK27Q12471 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.44□□□□□ -2.34
PFK27Q12471 YNL028WYNL028W 318 nt0.44□□□□□ -2.34
PFK27Q12471 STE5YDR103W 2754 nt0.44□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.8 ms