Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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