Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GOLGA3Q08378 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GOLGA3Q08378 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GOLGA3Q08378 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
GOLGA3Q08378 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GOLGA3Q08378 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GOLGA3Q08378 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GOLGA3Q08378 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
GOLGA3Q08378 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GOLGA3Q08378 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms