Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDR1Q08345 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms