Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FMODQ06828 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FMODQ06828 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FMODQ06828 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FMODQ06828 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FMODQ06828 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FMODQ06828 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FMODQ06828 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FMODQ06828 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FMODQ06828 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FMODQ06828 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FMODQ06828 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FMODQ06828 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FMODQ06828 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FMODQ06828 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FMODQ06828 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FMODQ06828 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FMODQ06828 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FMODQ06828 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FMODQ06828 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FMODQ06828 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FMODQ06828 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FMODQ06828 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FMODQ06828 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FMODQ06828 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FMODQ06828 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FMODQ06828 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FMODQ06828 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FMODQ06828 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FMODQ06828 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FMODQ06828 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FMODQ06828 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FMODQ06828 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FMODQ06828 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FMODQ06828 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FMODQ06828 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FMODQ06828 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FMODQ06828 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FMODQ06828 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FMODQ06828 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FMODQ06828 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FMODQ06828 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FMODQ06828 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FMODQ06828 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FMODQ06828 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FMODQ06828 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FMODQ06828 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FMODQ06828 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FMODQ06828 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FMODQ06828 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FMODQ06828 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FMODQ06828 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FMODQ06828 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FMODQ06828 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FMODQ06828 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FMODQ06828 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FMODQ06828 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FMODQ06828 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FMODQ06828 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FMODQ06828 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FMODQ06828 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FMODQ06828 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FMODQ06828 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FMODQ06828 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FMODQ06828 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FMODQ06828 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FMODQ06828 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FMODQ06828 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FMODQ06828 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FMODQ06828 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FMODQ06828 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FMODQ06828 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FMODQ06828 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FMODQ06828 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms