Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms