Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms