Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms