Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms