Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms