Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2C1P98194 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms