Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms