Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms