Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms