Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATN1P54259 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATN1P54259 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATN1P54259 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATN1P54259 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATN1P54259 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATN1P54259 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATN1P54259 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATN1P54259 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATN1P54259 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATN1P54259 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATN1P54259 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATN1P54259 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATN1P54259 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATN1P54259 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATN1P54259 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATN1P54259 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATN1P54259 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATN1P54259 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATN1P54259 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATN1P54259 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATN1P54259 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATN1P54259 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATN1P54259 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATN1P54259 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATN1P54259 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATN1P54259 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATN1P54259 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATN1P54259 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATN1P54259 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATN1P54259 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATN1P54259 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATN1P54259 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATN1P54259 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATN1P54259 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATN1P54259 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATN1P54259 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATN1P54259 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATN1P54259 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATN1P54259 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATN1P54259 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATN1P54259 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATN1P54259 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATN1P54259 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATN1P54259 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATN1P54259 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATN1P54259 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATN1P54259 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATN1P54259 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATN1P54259 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATN1P54259 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms