Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNP53814 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SMTNP53814 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMTNP53814 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMTNP53814 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNP53814 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNP53814 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNP53814 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNP53814 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNP53814 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNP53814 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNP53814 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNP53814 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNP53814 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNP53814 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNP53814 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNP53814 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNP53814 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNP53814 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNP53814 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNP53814 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNP53814 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNP53814 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNP53814 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNP53814 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNP53814 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNP53814 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNP53814 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNP53814 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNP53814 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNP53814 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNP53814 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNP53814 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNP53814 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNP53814 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNP53814 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNP53814 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNP53814 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNP53814 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNP53814 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNP53814 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNP53814 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNP53814 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNP53814 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNP53814 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNP53814 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNP53814 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNP53814 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNP53814 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNP53814 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNP53814 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNP53814 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNP53814 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNP53814 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNP53814 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNP53814 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNP53814 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNP53814 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNP53814 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNP53814 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNP53814 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNP53814 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNP53814 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNP53814 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNP53814 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNP53814 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms