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Protein–RNA interactions for Protein: P53551
HHO1, Histone H1, yeast
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258 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
HHO1
P53551
RAD61
YDR014W
1944 nt
-0.52
□□□□□ -2.49
HHO1
P53551
URB1
YKL014C
5295 nt
-0.52
□□□□□ -2.49
HHO1
P53551
HMLALPHA2
YCL067C
633 nt
-0.52
□□□□□ -2.49
HHO1
P53551
MATALPHA2
YCR039C
633 nt
-0.52
□□□□□ -2.49
HHO1
P53551
RPF1
YHR088W
888 nt
-0.52
□□□□□ -2.49
HHO1
P53551
TAR1
YLR154W-C
375 nt
-0.52
□□□□□ -2.49
HHO1
P53551
MRPS8
YMR158W
468 nt
-0.52
□□□□□ -2.49
HHO1
P53551
SVS1
YPL163C
783 nt
-0.52
□□□□□ -2.49
HHO1
P53551
YPR092W
YPR092W
306 nt
-0.52
□□□□□ -2.49
HHO1
P53551
YOR032W-A
YOR032W-A
201 nt
-0.53
□□□□□ -2.49
HHO1
P53551
SEC10
YLR166C
2616 nt
-0.54
□□□□□ -2.5
HHO1
P53551
DIE2
YGR227W
1578 nt
-0.54
□□□□□ -2.5
HHO1
P53551
YOL038C-A
YOL038C-A
96 nt
-0.55
□□□□□ -2.5
HHO1
P53551
YPL225W
YPL225W
441 nt
-0.55
□□□□□ -2.5
HHO1
P53551
YDL016C
YDL016C
303 nt
-0.56
□□□□□ -2.5
HHO1
P53551
YPL205C
YPL205C
345 nt
-0.56
□□□□□ -2.5
HHO1
P53551
YDL011C
YDL011C
324 nt
-0.57
□□□□□ -2.5
HHO1
P53551
YAL066W
YAL066W
309 nt
-0.58
□□□□□ -2.5
HHO1
P53551
YBL071C
YBL071C
309 nt
-0.58
□□□□□ -2.5
HHO1
P53551
YPL229W
YPL229W
621 nt
-0.58
□□□□□ -2.5
HHO1
P53551
PCF11
YDR228C
1881 nt
-0.58
□□□□□ -2.5
HHO1
P53551
HMRA2
YCR096C
360 nt
-0.59
□□□□□ -2.5
HHO1
P53551
YLR269C
YLR269C
351 nt
-0.59
□□□□□ -2.5
HHO1
P53551
YPR002C-A
YPR002C-A
198 nt
-0.59
□□□□□ -2.5
HHO1
P53551
snR46
snR46
197 nt
-0.59
□□□□□ -2.5
HHO1
P53551
YCR022C
YCR022C
345 nt
-0.6
□□□□□ -2.51
HHO1
P53551
YKL083W
YKL083W
615 nt
-0.61
□□□□□ -2.51
HHO1
P53551
ZEO1
YOL109W
342 nt
-0.61
□□□□□ -2.51
HHO1
P53551
YFR009W-A
YFR009W-A
258 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
HHO1
P53551
YIR030W-A
YIR030W-A
384 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
HHO1
P53551
YLR282C
YLR282C
342 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
HHO1
P53551
YDR426C
YDR426C
378 nt
-0.64
□□□□□ -2.51
HHO1
P53551
YLR287C
YLR287C
1068 nt
-0.64
□□□□□ -2.51
HHO1
P53551
YLR334C
YLR334C
381 nt
-0.65
□□□□□ -2.51
HHO1
P53551
YML007C-A
YML007C-A
111 nt
-0.65
□□□□□ -2.51
HHO1
P53551
CSE1
YGL238W
2883 nt
-0.65
□□□□□ -2.51
HHO1
P53551
FYV7
YLR068W
456 nt
-0.66
□□□□□ -2.52
HHO1
P53551
RPS25B
YLR333C
327 nt
-0.66
□□□□□ -2.52
HHO1
P53551
GRX5
YPL059W
453 nt
-0.66
□□□□□ -2.52
HHO1
P53551
YPL068C
YPL068C
882 nt
-0.66
□□□□□ -2.52
HHO1
P53551
YBR099C
YBR099C
384 nt
-0.66
□□□□□ -2.52
HHO1
P53551
EST1
YLR233C
2100 nt
-0.67
□□□□□ -2.52
HHO1
P53551
YHR138C
YHR138C
345 nt
-0.68
□□□□□ -2.52
HHO1
P53551
GPI15
YNL038W
690 nt
-0.68
□□□□□ -2.52
HHO1
P53551
SNU13
YEL026W
381 nt
-0.69
□□□□□ -2.52
HHO1
P53551
YNL303W
YNL303W
348 nt
-0.69
□□□□□ -2.52
HHO1
P53551
YOR192C-C
YOR192C-C
237 nt
-0.69
□□□□□ -2.52
HHO1
P53551
YBR072C-A
YBR072C-A
162 nt
-0.69
□□□□□ -2.52
HHO1
P53551
YDR354C-A
YDR354C-A
144 nt
-0.7
□□□□□ -2.52
HHO1
P53551
YHR007C-A
YHR007C-A
216 nt
-0.7
□□□□□ -2.52
HHO1
P53551
BLI1
YKL061W
342 nt
-0.7
□□□□□ -2.52
HHO1
P53551
YMR158W-B
YMR158W-B
321 nt
-0.7
□□□□□ -2.52
HHO1
P53551
YOR161W-A
YOR161W-A
81 nt
-0.7
□□□□□ -2.52
HHO1
P53551
MPC1
YGL080W
393 nt
-0.71
□□□□□ -2.52
HHO1
P53551
YGR174W-A
YGR174W-A
87 nt
-0.71
□□□□□ -2.52
HHO1
P53551
YJL120W
YJL120W
324 nt
-0.71
□□□□□ -2.52
HHO1
P53551
YPR170W-A
YPR170W-A
186 nt
-0.72
□□□□□ -2.52
HHO1
P53551
YAR047C
YAR047C
321 nt
-0.74
□□□□□ -2.53
HHO1
P53551
ISF1
YMR081C
1017 nt
-0.74
□□□□□ -2.53
HHO1
P53551
YIL071W-A
YIL071W-A
477 nt
-0.75
□□□□□ -2.53
HHO1
P53551
YNL067W-B
YNL067W-B
141 nt
-0.75
□□□□□ -2.53
HHO1
P53551
UTP8
YGR128C
2142 nt
-0.76
□□□□□ -2.53
HHO1
P53551
YDR366C
YDR366C
399 nt
-0.76
□□□□□ -2.53
HHO1
P53551
PCC1
YKR095W-A
267 nt
-0.77
□□□□□ -2.53
HHO1
P53551
YGL123C-A
YGL123C-A
231 nt
-0.79
□□□□□ -2.54
HHO1
P53551
YLR041W
YLR041W
321 nt
-0.79
□□□□□ -2.54
HHO1
P53551
YDL007C-A
YDL007C-A
258 nt
-0.8
□□□□□ -2.54
HHO1
P53551
YJL026C-A
YJL026C-A
222 nt
-0.8
□□□□□ -2.54
HHO1
P53551
CBS1
YDL069C
690 nt
-0.81
□□□□□ -2.54
HHO1
P53551
YFL012W
YFL012W
447 nt
-0.81
□□□□□ -2.54
HHO1
P53551
YHR125W
YHR125W
306 nt
-0.81
□□□□□ -2.54
HHO1
P53551
YLR456W
YLR456W
615 nt
-0.81
□□□□□ -2.54
HHO1
P53551
YER084W-A
YER084W-A
513 nt
-0.82
□□□□□ -2.54
HHO1
P53551
YJL047C-A
YJL047C-A
135 nt
-0.82
□□□□□ -2.54
HHO1
P53551
AIM29
YKR074W
468 nt
-0.83
□□□□□ -2.54
HHO1
P53551
YLR285C-A
YLR285C-A
171 nt
-0.83
□□□□□ -2.54
HHO1
P53551
RPM2
YML091C
3609 nt
-0.84
□□□□□ -2.54
HHO1
P53551
YLR264C-A
YLR264C-A
117 nt
-0.84
□□□□□ -2.54
HHO1
P53551
snR33
snR33
183 nt
-0.84
□□□□□ -2.54
HHO1
P53551
YJL113W
YJL113W
4647 nt
-0.85
□□□□□ -2.55
HHO1
P53551
tA(UGC)Q
tA(UGC)Q
76 nt
-0.87
□□□□□ -2.55
HHO1
P53551
AGA2
YGL032C
264 nt
-0.87
□□□□□ -2.55
HHO1
P53551
YAR029W
YAR029W
225 nt
-0.87
□□□□□ -2.55
HHO1
P53551
GLG1
YKR058W
1851 nt
-0.88
□□□□□ -2.55
HHO1
P53551
SDH6
YDR379C-A
240 nt
-0.88
□□□□□ -2.55
HHO1
P53551
YHR130C
YHR130C
336 nt
-0.88
□□□□□ -2.55
HHO1
P53551
YKL100W-A
YKL100W-A
90 nt
-0.88
□□□□□ -2.55
HHO1
P53551
PRM3
YPL192C
402 nt
-0.88
□□□□□ -2.55
HHO1
P53551
YEL020C-B
YEL020C-B
198 nt
-0.89
□□□□□ -2.55
HHO1
P53551
PAU9
YBL108C-A
129 nt
-0.89
□□□□□ -2.55
HHO1
P53551
tT(UGU)G1
tT(UGU)G1
72 nt
-0.9
□□□□□ -2.55
HHO1
P53551
tT(UGU)G2
tT(UGU)G2
72 nt
-0.9
□□□□□ -2.55
HHO1
P53551
tT(UGU)P
tT(UGU)P
72 nt
-0.9
□□□□□ -2.55
HHO1
P53551
EAF6
YJR082C
342 nt
-0.9
□□□□□ -2.55
HHO1
P53551
YHL009W-B
YHL009W-B
5409 nt
-0.9
□□□□□ -2.55
HHO1
P53551
Q0255
Q0255
1419 nt
-0.91
□□□□□ -2.56
HHO1
P53551
YPL060C-A
YPL060C-A
3315 nt
-0.93
□□□□□ -2.56
HHO1
P53551
YER079W
YER079W
633 nt
-0.93
□□□□□ -2.56
HHO1
P53551
YFL063W
YFL063W
456 nt
-0.95
□□□□□ -2.56
HHO1
P53551
CSN9
YDR179C
489 nt
-0.96
□□□□□ -2.56
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