Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP98P52948 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP98P52948 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP98P52948 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP98P52948 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP98P52948 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP98P52948 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP98P52948 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP98P52948 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP98P52948 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP98P52948 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP98P52948 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP98P52948 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP98P52948 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP98P52948 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP98P52948 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP98P52948 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP98P52948 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP98P52948 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP98P52948 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP98P52948 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP98P52948 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP98P52948 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP98P52948 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP98P52948 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP98P52948 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP98P52948 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP98P52948 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP98P52948 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP98P52948 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP98P52948 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP98P52948 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP98P52948 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP98P52948 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP98P52948 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP98P52948 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP98P52948 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP98P52948 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP98P52948 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP98P52948 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP98P52948 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP98P52948 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP98P52948 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP98P52948 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP98P52948 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP98P52948 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP98P52948 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP98P52948 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP98P52948 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP98P52948 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP98P52948 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP98P52948 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP98P52948 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP98P52948 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP98P52948 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP98P52948 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP98P52948 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP98P52948 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP98P52948 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP98P52948 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP98P52948 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP98P52948 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP98P52948 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP98P52948 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP98P52948 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP98P52948 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP98P52948 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP98P52948 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP98P52948 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP98P52948 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP98P52948 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP98P52948 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP98P52948 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP98P52948 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP98P52948 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP98P52948 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP98P52948 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP98P52948 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP98P52948 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP98P52948 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP98P52948 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP98P52948 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP98P52948 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP98P52948 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP98P52948 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP98P52948 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP98P52948 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP98P52948 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP98P52948 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP98P52948 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP98P52948 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP98P52948 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP98P52948 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP98P52948 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP98P52948 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP98P52948 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP98P52948 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP98P52948 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP98P52948 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP98P52948 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms