Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DAP3P51398 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DAP3P51398 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DAP3P51398 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DAP3P51398 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DAP3P51398 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DAP3P51398 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DAP3P51398 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DAP3P51398 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DAP3P51398 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DAP3P51398 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DAP3P51398 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DAP3P51398 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DAP3P51398 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DAP3P51398 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DAP3P51398 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DAP3P51398 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DAP3P51398 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DAP3P51398 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DAP3P51398 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DAP3P51398 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DAP3P51398 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DAP3P51398 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DAP3P51398 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DAP3P51398 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DAP3P51398 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DAP3P51398 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DAP3P51398 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DAP3P51398 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DAP3P51398 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DAP3P51398 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DAP3P51398 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
DAP3P51398 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
DAP3P51398 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DAP3P51398 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
DAP3P51398 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DAP3P51398 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DAP3P51398 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DAP3P51398 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DAP3P51398 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DAP3P51398 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DAP3P51398 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DAP3P51398 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DAP3P51398 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DAP3P51398 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DAP3P51398 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DAP3P51398 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DAP3P51398 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DAP3P51398 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DAP3P51398 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DAP3P51398 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DAP3P51398 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DAP3P51398 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DAP3P51398 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DAP3P51398 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DAP3P51398 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DAP3P51398 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DAP3P51398 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DAP3P51398 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DAP3P51398 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DAP3P51398 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DAP3P51398 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DAP3P51398 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DAP3P51398 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DAP3P51398 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DAP3P51398 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DAP3P51398 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DAP3P51398 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DAP3P51398 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DAP3P51398 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DAP3P51398 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DAP3P51398 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DAP3P51398 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DAP3P51398 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DAP3P51398 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DAP3P51398 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms