Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK2P49760 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK2P49760 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK2P49760 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK2P49760 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK2P49760 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK2P49760 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK2P49760 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK2P49760 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK2P49760 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK2P49760 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK2P49760 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK2P49760 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK2P49760 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK2P49760 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK2P49760 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK2P49760 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK2P49760 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK2P49760 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK2P49760 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK2P49760 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK2P49760 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK2P49760 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK2P49760 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK2P49760 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLK2P49760 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLK2P49760 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK2P49760 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK2P49760 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK2P49760 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK2P49760 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK2P49760 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK2P49760 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK2P49760 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK2P49760 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK2P49760 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK2P49760 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK2P49760 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK2P49760 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK2P49760 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK2P49760 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK2P49760 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK2P49760 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK2P49760 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK2P49760 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK2P49760 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK2P49760 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK2P49760 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK2P49760 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK2P49760 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK2P49760 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK2P49760 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK2P49760 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK2P49760 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK2P49760 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK2P49760 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK2P49760 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK2P49760 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK2P49760 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK2P49760 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK2P49760 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK2P49760 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK2P49760 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK2P49760 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK2P49760 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK2P49760 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK2P49760 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK2P49760 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK2P49760 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK2P49760 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK2P49760 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK2P49760 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK2P49760 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK2P49760 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK2P49760 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK2P49760 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK2P49760 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK2P49760 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK2P49760 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK2P49760 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK2P49760 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK2P49760 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK2P49760 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK2P49760 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK2P49760 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK2P49760 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK2P49760 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK2P49760 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK2P49760 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK2P49760 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK2P49760 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK2P49760 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK2P49760 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK2P49760 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK2P49760 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK2P49760 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK2P49760 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK2P49760 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK2P49760 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK2P49760 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms