Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms