Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XCR1P46094 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
XCR1P46094 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCR1P46094 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCR1P46094 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCR1P46094 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCR1P46094 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCR1P46094 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCR1P46094 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCR1P46094 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCR1P46094 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCR1P46094 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCR1P46094 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCR1P46094 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCR1P46094 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCR1P46094 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCR1P46094 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCR1P46094 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCR1P46094 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCR1P46094 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
XCR1P46094 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCR1P46094 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCR1P46094 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCR1P46094 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
XCR1P46094 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCR1P46094 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCR1P46094 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCR1P46094 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
XCR1P46094 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
XCR1P46094 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
XCR1P46094 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XCR1P46094 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XCR1P46094 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XCR1P46094 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XCR1P46094 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XCR1P46094 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XCR1P46094 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XCR1P46094 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XCR1P46094 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
XCR1P46094 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XCR1P46094 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XCR1P46094 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XCR1P46094 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XCR1P46094 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XCR1P46094 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XCR1P46094 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XCR1P46094 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
XCR1P46094 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XCR1P46094 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XCR1P46094 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XCR1P46094 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XCR1P46094 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XCR1P46094 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XCR1P46094 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XCR1P46094 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XCR1P46094 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XCR1P46094 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XCR1P46094 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XCR1P46094 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XCR1P46094 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XCR1P46094 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XCR1P46094 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XCR1P46094 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XCR1P46094 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
XCR1P46094 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
XCR1P46094 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XCR1P46094 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XCR1P46094 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
XCR1P46094 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XCR1P46094 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
XCR1P46094 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XCR1P46094 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
XCR1P46094 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
XCR1P46094 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms