Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DCCP43146 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DCCP43146 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DCCP43146 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DCCP43146 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DCCP43146 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DCCP43146 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DCCP43146 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DCCP43146 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DCCP43146 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DCCP43146 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DCCP43146 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DCCP43146 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCCP43146 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCCP43146 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCCP43146 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCCP43146 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCCP43146 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCCP43146 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCCP43146 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCCP43146 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCCP43146 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCCP43146 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCCP43146 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCCP43146 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCCP43146 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCCP43146 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCCP43146 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCCP43146 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DCCP43146 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCCP43146 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCCP43146 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCCP43146 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCCP43146 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DCCP43146 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCCP43146 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCCP43146 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCCP43146 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCCP43146 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCCP43146 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCCP43146 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DCCP43146 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DCCP43146 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DCCP43146 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCCP43146 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DCCP43146 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCCP43146 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCCP43146 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCCP43146 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCCP43146 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCCP43146 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DCCP43146 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCCP43146 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCCP43146 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCCP43146 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCCP43146 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCCP43146 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCCP43146 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCCP43146 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCCP43146 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DCCP43146 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCCP43146 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCCP43146 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCCP43146 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCCP43146 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DCCP43146 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DCCP43146 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCCP43146 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DCCP43146 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCCP43146 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCCP43146 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCCP43146 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCCP43146 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCCP43146 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCCP43146 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DCCP43146 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCCP43146 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCCP43146 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCCP43146 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCCP43146 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DCCP43146 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCCP43146 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCCP43146 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCCP43146 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCCP43146 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCCP43146 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCCP43146 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCCP43146 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCCP43146 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.58■■■□□ 2
DCCP43146 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.58■■■□□ 2
DCCP43146 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
DCCP43146 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
DCCP43146 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
DCCP43146 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
DCCP43146 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DCCP43146 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DCCP43146 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
DCCP43146 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DCCP43146 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
DCCP43146 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms