Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCAMP43121 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCAMP43121 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MCAMP43121 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCAMP43121 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCAMP43121 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCAMP43121 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCAMP43121 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCAMP43121 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCAMP43121 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCAMP43121 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCAMP43121 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCAMP43121 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCAMP43121 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCAMP43121 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCAMP43121 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCAMP43121 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCAMP43121 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCAMP43121 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCAMP43121 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCAMP43121 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCAMP43121 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MCAMP43121 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCAMP43121 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCAMP43121 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCAMP43121 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCAMP43121 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCAMP43121 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCAMP43121 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCAMP43121 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCAMP43121 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCAMP43121 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCAMP43121 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCAMP43121 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCAMP43121 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCAMP43121 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCAMP43121 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCAMP43121 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MCAMP43121 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCAMP43121 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCAMP43121 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCAMP43121 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCAMP43121 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MCAMP43121 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCAMP43121 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCAMP43121 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCAMP43121 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCAMP43121 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCAMP43121 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCAMP43121 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCAMP43121 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCAMP43121 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCAMP43121 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCAMP43121 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCAMP43121 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCAMP43121 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCAMP43121 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCAMP43121 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCAMP43121 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MCAMP43121 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCAMP43121 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCAMP43121 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCAMP43121 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCAMP43121 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCAMP43121 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCAMP43121 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCAMP43121 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCAMP43121 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCAMP43121 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCAMP43121 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCAMP43121 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCAMP43121 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCAMP43121 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCAMP43121 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCAMP43121 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCAMP43121 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCAMP43121 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCAMP43121 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCAMP43121 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCAMP43121 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCAMP43121 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCAMP43121 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MCAMP43121 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCAMP43121 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCAMP43121 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCAMP43121 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCAMP43121 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCAMP43121 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCAMP43121 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCAMP43121 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCAMP43121 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCAMP43121 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCAMP43121 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCAMP43121 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCAMP43121 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCAMP43121 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MCAMP43121 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCAMP43121 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCAMP43121 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCAMP43121 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms