Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms