Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms