Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms