Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms