Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms