Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTGFP29279 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTGFP29279 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTGFP29279 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTGFP29279 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTGFP29279 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTGFP29279 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTGFP29279 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTGFP29279 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTGFP29279 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTGFP29279 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTGFP29279 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTGFP29279 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTGFP29279 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTGFP29279 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTGFP29279 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTGFP29279 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTGFP29279 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTGFP29279 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTGFP29279 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTGFP29279 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTGFP29279 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTGFP29279 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTGFP29279 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTGFP29279 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTGFP29279 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTGFP29279 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTGFP29279 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTGFP29279 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTGFP29279 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTGFP29279 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTGFP29279 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTGFP29279 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTGFP29279 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTGFP29279 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTGFP29279 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTGFP29279 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTGFP29279 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTGFP29279 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTGFP29279 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTGFP29279 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTGFP29279 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTGFP29279 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTGFP29279 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTGFP29279 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTGFP29279 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTGFP29279 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTGFP29279 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTGFP29279 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTGFP29279 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTGFP29279 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTGFP29279 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTGFP29279 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTGFP29279 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTGFP29279 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTGFP29279 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTGFP29279 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTGFP29279 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTGFP29279 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTGFP29279 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTGFP29279 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTGFP29279 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTGFP29279 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTGFP29279 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTGFP29279 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTGFP29279 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTGFP29279 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTGFP29279 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTGFP29279 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTGFP29279 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTGFP29279 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTGFP29279 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTGFP29279 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTGFP29279 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTGFP29279 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTGFP29279 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTGFP29279 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTGFP29279 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTGFP29279 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTGFP29279 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTGFP29279 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTGFP29279 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTGFP29279 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTGFP29279 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTGFP29279 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTGFP29279 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTGFP29279 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTGFP29279 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTGFP29279 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTGFP29279 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTGFP29279 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTGFP29279 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTGFP29279 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTGFP29279 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTGFP29279 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTGFP29279 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTGFP29279 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTGFP29279 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTGFP29279 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTGFP29279 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms