Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD1P28340 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD1P28340 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD1P28340 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD1P28340 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD1P28340 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD1P28340 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD1P28340 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD1P28340 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD1P28340 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD1P28340 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD1P28340 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD1P28340 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD1P28340 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD1P28340 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD1P28340 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD1P28340 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD1P28340 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD1P28340 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD1P28340 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD1P28340 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD1P28340 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD1P28340 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD1P28340 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD1P28340 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD1P28340 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD1P28340 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD1P28340 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD1P28340 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD1P28340 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD1P28340 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD1P28340 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD1P28340 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLD1P28340 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLD1P28340 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLD1P28340 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLD1P28340 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLD1P28340 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLD1P28340 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLD1P28340 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POLD1P28340 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLD1P28340 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLD1P28340 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLD1P28340 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POLD1P28340 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLD1P28340 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLD1P28340 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLD1P28340 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLD1P28340 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLD1P28340 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD1P28340 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD1P28340 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD1P28340 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD1P28340 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD1P28340 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD1P28340 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD1P28340 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD1P28340 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD1P28340 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD1P28340 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD1P28340 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD1P28340 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD1P28340 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD1P28340 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD1P28340 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD1P28340 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD1P28340 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD1P28340 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD1P28340 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD1P28340 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD1P28340 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD1P28340 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD1P28340 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD1P28340 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD1P28340 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD1P28340 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD1P28340 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD1P28340 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD1P28340 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD1P28340 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD1P28340 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD1P28340 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD1P28340 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD1P28340 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD1P28340 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD1P28340 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD1P28340 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD1P28340 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD1P28340 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLD1P28340 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLD1P28340 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLD1P28340 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLD1P28340 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLD1P28340 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
POLD1P28340 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLD1P28340 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLD1P28340 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLD1P28340 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLD1P28340 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLD1P28340 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms