Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCD3P28288 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms