Protein–RNA interactions for Protein: P27344

DPB3, DNA polymerase epsilon subunit C, yeastyeast

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DPB3P27344 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.05□□□□□ -2.24
DPB3P27344 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.05□□□□□ -2.24
DPB3P27344 SGF11YPL047W 300 nt1.05□□□□□ -2.24
DPB3P27344 BUD3YCL014W 4911 nt1.04□□□□□ -2.24
DPB3P27344 SMC1YFL008W 3678 nt1.03□□□□□ -2.24
DPB3P27344 IES4YOR189W 351 nt1.03□□□□□ -2.24
DPB3P27344 NHP2YDL208W 471 nt1.02□□□□□ -2.25
DPB3P27344 YFL032WYFL032W 321 nt1.02□□□□□ -2.25
DPB3P27344 YIL032CYIL032C 357 nt1.02□□□□□ -2.25
DPB3P27344 snR60snR60 104 nt1.01□□□□□ -2.25
DPB3P27344 RPS27BYHR021C 249 nt1.01□□□□□ -2.25
DPB3P27344 VIK1YPL253C 1944 nt1.01□□□□□ -2.25
DPB3P27344 PAA1YDR071C 576 nt1□□□□□ -2.25
DPB3P27344 YKL118WYKL118W 312 nt1□□□□□ -2.25
DPB3P27344 YER097WYER097W 330 nt0.99□□□□□ -2.25
DPB3P27344 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.98□□□□□ -2.25
DPB3P27344 YDR413CYDR413C 576 nt0.97□□□□□ -2.25
DPB3P27344 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.96□□□□□ -2.26
DPB3P27344 PAU24YBR301W 363 nt0.96□□□□□ -2.26
DPB3P27344 CHS6YJL099W 2241 nt0.96□□□□□ -2.26
DPB3P27344 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.95□□□□□ -2.26
DPB3P27344 YGL149WYGL149W 306 nt0.95□□□□□ -2.26
DPB3P27344 RPL26BYGR034W 384 nt0.95□□□□□ -2.26
DPB3P27344 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.94□□□□□ -2.26
DPB3P27344 YOR218CYOR218C 420 nt0.94□□□□□ -2.26
DPB3P27344 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.93□□□□□ -2.26
DPB3P27344 NPR2YEL062W 1848 nt0.92□□□□□ -2.26
DPB3P27344 CSE2YNR010W 450 nt0.92□□□□□ -2.26
DPB3P27344 STE5YDR103W 2754 nt0.91□□□□□ -2.26
DPB3P27344 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.91□□□□□ -2.26
DPB3P27344 ANS1YHR126C 480 nt0.91□□□□□ -2.26
DPB3P27344 YOR015WYOR015W 360 nt0.91□□□□□ -2.26
DPB3P27344 RPL39YJL189W 156 nt0.9□□□□□ -2.27
DPB3P27344 SEC1YDR164C 2175 nt0.89□□□□□ -2.27
DPB3P27344 YKL136WYKL136W 399 nt0.89□□□□□ -2.27
DPB3P27344 LTE1YAL024C 4308 nt0.88□□□□□ -2.27
DPB3P27344 FYV10YIL097W 1551 nt0.88□□□□□ -2.27
DPB3P27344 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.88□□□□□ -2.27
DPB3P27344 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt0.87□□□□□ -2.27
DPB3P27344 SEC8YPR055W 3198 nt0.87□□□□□ -2.27
DPB3P27344 HAL9YOL089C 3093 nt0.87□□□□□ -2.27
DPB3P27344 UBP3YER151C 2739 nt0.87□□□□□ -2.27
DPB3P27344 PRP5YBR237W 2550 nt0.86□□□□□ -2.27
DPB3P27344 YNL028WYNL028W 318 nt0.86□□□□□ -2.27
DPB3P27344 YML002WYML002W 2214 nt0.85□□□□□ -2.27
DPB3P27344 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.84□□□□□ -2.27
DPB3P27344 snR190snR190 190 nt0.84□□□□□ -2.27
DPB3P27344 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.82□□□□□ -2.28
DPB3P27344 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.82□□□□□ -2.28
DPB3P27344 RAD61YDR014W 1944 nt0.81□□□□□ -2.28
DPB3P27344 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.81□□□□□ -2.28
DPB3P27344 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.81□□□□□ -2.28
DPB3P27344 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.79□□□□□ -2.28
DPB3P27344 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.79□□□□□ -2.28
DPB3P27344 OST4YDL232W 111 nt0.78□□□□□ -2.28
DPB3P27344 COX5BYIL111W 456 nt0.78□□□□□ -2.28
DPB3P27344 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.78□□□□□ -2.28
DPB3P27344 YGR069WYGR069W 336 nt0.77□□□□□ -2.29
DPB3P27344 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.77□□□□□ -2.29
DPB3P27344 COY1YKL179C 2040 nt0.76□□□□□ -2.29
DPB3P27344 YLR282CYLR282C 342 nt0.76□□□□□ -2.29
DPB3P27344 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.76□□□□□ -2.29
DPB3P27344 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.75□□□□□ -2.29
DPB3P27344 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt0.75□□□□□ -2.29
DPB3P27344 YOR345CYOR345C 351 nt0.75□□□□□ -2.29
DPB3P27344 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.74□□□□□ -2.29
DPB3P27344 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt0.74□□□□□ -2.29
DPB3P27344 YSP1YHR155W 3687 nt0.74□□□□□ -2.29
DPB3P27344 ULI1YFR026C 510 nt0.73□□□□□ -2.29
DPB3P27344 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.73□□□□□ -2.29
DPB3P27344 YPR092WYPR092W 306 nt0.73□□□□□ -2.29
DPB3P27344 PRP42YDR235W 1635 nt0.73□□□□□ -2.29
DPB3P27344 BEM3YPL115C 3387 nt0.73□□□□□ -2.29
DPB3P27344 YCR022CYCR022C 345 nt0.72□□□□□ -2.29
DPB3P27344 snR74snR74 88 nt0.72□□□□□ -2.29
DPB3P27344 YGL052WYGL052W 306 nt0.72□□□□□ -2.29
DPB3P27344 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.72□□□□□ -2.29
DPB3P27344 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.72□□□□□ -2.29
DPB3P27344 UTP10YJL109C 5310 nt0.72□□□□□ -2.29
DPB3P27344 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.71□□□□□ -2.3
DPB3P27344 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.71□□□□□ -2.3
DPB3P27344 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.71□□□□□ -2.3
DPB3P27344 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.71□□□□□ -2.3
DPB3P27344 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
DPB3P27344 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
DPB3P27344 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.71□□□□□ -2.3
DPB3P27344 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
DPB3P27344 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
DPB3P27344 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
DPB3P27344 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
DPB3P27344 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.7□□□□□ -2.3
DPB3P27344 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.69□□□□□ -2.3
DPB3P27344 YLR041WYLR041W 321 nt0.69□□□□□ -2.3
DPB3P27344 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.69□□□□□ -2.3
DPB3P27344 PAU12YGR294W 363 nt0.66□□□□□ -2.3
DPB3P27344 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.66□□□□□ -2.3
DPB3P27344 Q0142Q0142 177 nt0.65□□□□□ -2.31
DPB3P27344 PAM16YJL104W 450 nt0.65□□□□□ -2.31
DPB3P27344 snR65snR65 100 nt0.64□□□□□ -2.31
DPB3P27344 COX12YLR038C 252 nt0.64□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.6 ms