Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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