Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2B1P20020 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms