Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIG1P18858 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIG1P18858 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIG1P18858 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIG1P18858 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIG1P18858 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIG1P18858 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIG1P18858 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIG1P18858 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIG1P18858 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIG1P18858 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIG1P18858 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIG1P18858 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIG1P18858 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIG1P18858 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIG1P18858 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIG1P18858 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIG1P18858 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIG1P18858 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIG1P18858 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIG1P18858 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIG1P18858 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIG1P18858 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIG1P18858 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIG1P18858 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIG1P18858 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIG1P18858 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIG1P18858 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIG1P18858 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIG1P18858 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIG1P18858 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIG1P18858 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIG1P18858 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LIG1P18858 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIG1P18858 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LIG1P18858 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIG1P18858 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIG1P18858 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIG1P18858 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIG1P18858 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIG1P18858 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIG1P18858 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIG1P18858 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIG1P18858 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LIG1P18858 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIG1P18858 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIG1P18858 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LIG1P18858 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIG1P18858 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LIG1P18858 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIG1P18858 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LIG1P18858 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LIG1P18858 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LIG1P18858 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LIG1P18858 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LIG1P18858 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LIG1P18858 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LIG1P18858 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIG1P18858 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIG1P18858 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIG1P18858 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LIG1P18858 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIG1P18858 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIG1P18858 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIG1P18858 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIG1P18858 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LIG1P18858 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIG1P18858 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LIG1P18858 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIG1P18858 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIG1P18858 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIG1P18858 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIG1P18858 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIG1P18858 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIG1P18858 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIG1P18858 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIG1P18858 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIG1P18858 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LIG1P18858 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIG1P18858 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LIG1P18858 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LIG1P18858 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIG1P18858 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIG1P18858 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIG1P18858 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIG1P18858 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIG1P18858 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LIG1P18858 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIG1P18858 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIG1P18858 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LIG1P18858 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIG1P18858 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIG1P18858 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIG1P18858 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIG1P18858 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIG1P18858 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIG1P18858 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIG1P18858 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LIG1P18858 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIG1P18858 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms