Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD44P16070 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD44P16070 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD44P16070 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD44P16070 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD44P16070 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD44P16070 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD44P16070 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD44P16070 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD44P16070 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD44P16070 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD44P16070 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD44P16070 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD44P16070 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD44P16070 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD44P16070 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD44P16070 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD44P16070 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD44P16070 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD44P16070 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD44P16070 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD44P16070 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD44P16070 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD44P16070 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD44P16070 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD44P16070 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD44P16070 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD44P16070 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CD44P16070 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD44P16070 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD44P16070 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD44P16070 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD44P16070 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD44P16070 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD44P16070 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD44P16070 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD44P16070 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD44P16070 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD44P16070 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD44P16070 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD44P16070 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD44P16070 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD44P16070 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD44P16070 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD44P16070 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD44P16070 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD44P16070 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD44P16070 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD44P16070 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD44P16070 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD44P16070 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CD44P16070 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD44P16070 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD44P16070 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD44P16070 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD44P16070 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD44P16070 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD44P16070 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD44P16070 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD44P16070 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CD44P16070 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD44P16070 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD44P16070 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD44P16070 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD44P16070 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD44P16070 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD44P16070 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD44P16070 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CD44P16070 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD44P16070 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD44P16070 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD44P16070 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD44P16070 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD44P16070 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD44P16070 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD44P16070 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD44P16070 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD44P16070 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD44P16070 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD44P16070 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD44P16070 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD44P16070 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD44P16070 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD44P16070 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD44P16070 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD44P16070 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD44P16070 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD44P16070 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD44P16070 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD44P16070 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD44P16070 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD44P16070 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD44P16070 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD44P16070 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD44P16070 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD44P16070 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD44P16070 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD44P16070 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD44P16070 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD44P16070 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms