Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG2P13521 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG2P13521 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG2P13521 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG2P13521 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG2P13521 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG2P13521 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG2P13521 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG2P13521 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG2P13521 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG2P13521 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG2P13521 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG2P13521 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG2P13521 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG2P13521 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG2P13521 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG2P13521 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG2P13521 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG2P13521 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCG2P13521 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCG2P13521 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG2P13521 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG2P13521 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG2P13521 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG2P13521 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG2P13521 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG2P13521 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG2P13521 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG2P13521 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG2P13521 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG2P13521 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG2P13521 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG2P13521 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG2P13521 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG2P13521 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG2P13521 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG2P13521 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG2P13521 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG2P13521 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG2P13521 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG2P13521 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG2P13521 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG2P13521 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG2P13521 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG2P13521 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG2P13521 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG2P13521 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG2P13521 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG2P13521 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG2P13521 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG2P13521 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG2P13521 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG2P13521 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG2P13521 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG2P13521 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG2P13521 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG2P13521 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG2P13521 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG2P13521 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG2P13521 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG2P13521 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG2P13521 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG2P13521 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG2P13521 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG2P13521 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG2P13521 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG2P13521 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG2P13521 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG2P13521 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG2P13521 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG2P13521 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG2P13521 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG2P13521 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG2P13521 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG2P13521 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms