Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GLI4P10075 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GLI4P10075 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GLI4P10075 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GLI4P10075 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GLI4P10075 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GLI4P10075 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GLI4P10075 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GLI4P10075 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GLI4P10075 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GLI4P10075 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GLI4P10075 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GLI4P10075 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GLI4P10075 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GLI4P10075 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GLI4P10075 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GLI4P10075 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GLI4P10075 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GLI4P10075 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GLI4P10075 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GLI4P10075 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GLI4P10075 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GLI4P10075 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GLI4P10075 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GLI4P10075 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GLI4P10075 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GLI4P10075 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GLI4P10075 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GLI4P10075 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GLI4P10075 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GLI4P10075 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GLI4P10075 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GLI4P10075 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GLI4P10075 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GLI4P10075 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GLI4P10075 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GLI4P10075 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GLI4P10075 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GLI4P10075 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GLI4P10075 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GLI4P10075 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GLI4P10075 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GLI4P10075 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GLI4P10075 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GLI4P10075 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GLI4P10075 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GLI4P10075 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GLI4P10075 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GLI4P10075 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GLI4P10075 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GLI4P10075 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GLI4P10075 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GLI4P10075 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GLI4P10075 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GLI4P10075 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GLI4P10075 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GLI4P10075 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GLI4P10075 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GLI4P10075 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GLI4P10075 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GLI4P10075 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GLI4P10075 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms