Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SAA2P0DJI9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms