Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms