Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms