Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDNEP1O95476 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDNEP1O95476 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDNEP1O95476 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms