Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPBO95292 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPBO95292 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPBO95292 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPBO95292 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPBO95292 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPBO95292 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPBO95292 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPBO95292 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPBO95292 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPBO95292 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPBO95292 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPBO95292 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPBO95292 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPBO95292 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPBO95292 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPBO95292 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPBO95292 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPBO95292 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPBO95292 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPBO95292 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPBO95292 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPBO95292 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPBO95292 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPBO95292 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPBO95292 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPBO95292 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPBO95292 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPBO95292 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPBO95292 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPBO95292 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPBO95292 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPBO95292 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPBO95292 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPBO95292 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPBO95292 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPBO95292 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPBO95292 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPBO95292 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPBO95292 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPBO95292 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPBO95292 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPBO95292 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPBO95292 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPBO95292 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPBO95292 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPBO95292 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPBO95292 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPBO95292 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPBO95292 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPBO95292 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPBO95292 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPBO95292 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPBO95292 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPBO95292 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPBO95292 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPBO95292 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAPBO95292 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAPBO95292 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAPBO95292 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAPBO95292 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAPBO95292 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAPBO95292 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VAPBO95292 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VAPBO95292 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAPBO95292 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAPBO95292 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAPBO95292 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAPBO95292 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAPBO95292 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VAPBO95292 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAPBO95292 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAPBO95292 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAPBO95292 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms