Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP19O94966 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP19O94966 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP19O94966 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP19O94966 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USP19O94966 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP19O94966 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP19O94966 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USP19O94966 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USP19O94966 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USP19O94966 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP19O94966 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP19O94966 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP19O94966 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP19O94966 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP19O94966 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP19O94966 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP19O94966 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP19O94966 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP19O94966 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP19O94966 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP19O94966 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP19O94966 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP19O94966 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP19O94966 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP19O94966 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP19O94966 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP19O94966 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP19O94966 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP19O94966 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP19O94966 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP19O94966 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP19O94966 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP19O94966 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP19O94966 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP19O94966 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP19O94966 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP19O94966 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP19O94966 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP19O94966 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP19O94966 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP19O94966 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
USP19O94966 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP19O94966 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP19O94966 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP19O94966 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP19O94966 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP19O94966 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
USP19O94966 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
USP19O94966 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP19O94966 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
USP19O94966 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
USP19O94966 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
USP19O94966 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP19O94966 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP19O94966 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP19O94966 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP19O94966 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP19O94966 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP19O94966 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP19O94966 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP19O94966 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP19O94966 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP19O94966 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP19O94966 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP19O94966 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP19O94966 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP19O94966 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP19O94966 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP19O94966 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP19O94966 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP19O94966 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP19O94966 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP19O94966 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP19O94966 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP19O94966 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP19O94966 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP19O94966 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP19O94966 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
USP19O94966 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP19O94966 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP19O94966 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
USP19O94966 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP19O94966 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP19O94966 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP19O94966 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP19O94966 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP19O94966 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP19O94966 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP19O94966 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP19O94966 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP19O94966 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP19O94966 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP19O94966 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP19O94966 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP19O94966 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP19O94966 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP19O94966 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP19O94966 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP19O94966 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms