Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM2O43147 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SGSM2O43147 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SGSM2O43147 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM2O43147 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM2O43147 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM2O43147 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM2O43147 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM2O43147 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM2O43147 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM2O43147 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM2O43147 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM2O43147 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM2O43147 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM2O43147 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM2O43147 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM2O43147 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM2O43147 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM2O43147 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM2O43147 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM2O43147 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms